За тонким кишечником начинается толстый. Он отделен от тонкого слизистой заслонкой, чтоб не было заброса содержимого из толстого кишечника обратно в тонкий, и чтоб в тонкий не попадали микроорганизмы, в большом количестве живущие в толстом. Недалеко от заслонки находится отросток толстой (слепой) кишки, известный всем как аппендикс. Это орган иммунитета.

Толстый кишечник состоит из слепой кишки, восходящей, поперечной и нисходящей ободочных и сигмовидной. Заканчивается все прямой кишкой. Строение толстого кишечника кардинально отличается от строения тонкого кишечника, и функции он выполняет абсолютно иные. В нем уже не происходит переваривание пищи и всасывание питательных веществ, зато всасывается вода и есть около 1,5 кг различных микроорганизмов. Они очень важны для нашего существования.

Нормальная микрофлора кишечника - это комплексная, динамически сбалансированная экосистема, характеризующаяся определенным составом, включающая в себя более 500 видов бактерий.

Основными представителями кишечной микрофлоры являются аэробные лактобактерии (L. acidophilus, L. plantarum, L. casei, L. fermentum, L. salivores, L. cellobiosus) и анаэробные бифидобактерии (Bifidumbakterium bifidum, В. bifidus, B. infantis, B. longum, B. аdolescentis).